Forklaringer til forkortelser

 

 

 

start  =             Startposisjonen

                        Posisjonen til primerens 5’-base

                        For den venstre primeren er dette posisjonen til basen lengst til venstre

                        For den høyre primeren er dette posisjonen til basen lengst til høyre

 

lengde =           Primer-lengden

                        Antall baser primeren består av

 

tm =                 Smeltetemperaturen til primeren

 

gc% =              Prosentandelen av G eller C baser i primeren

 

any =               Selv-komplementariteten til primeren

            Verdien angir primerens tendens til å binde seg til seg selv eller danne sekundære strukturer

 

3’ =                 3’-selv-komplementatiteten til primeren

                        Verdien angir primerens tendens til å danne en primer-dimer med seg selv

 

sekvens =        Primer-sekvensen (5’® 3’)

                       

 

 

Tilbake til øving 3